Ola @colazante93
Temos que entender o que ocasionou essa mudança.
Meu chute é - de alguma forma o seu dado mudou e está gerando duplicatas, o famoso cross join, e isso gera um output com muitas linhas a mais do que esperado, além de claro, aumentar o tempo de execução.
Outra questão é que quando se faz join com strings muito longas, naturalmente o processamento é mais lento, pois a verificação do join para dar o "match" é mais exaustiva.
Por último, existe também processamento de máquina. Joins se utilizam muito da memória RAM disponível, e se por acaso sua máquina tem pouca memória disponível, o workflow irá demorar mais.
Abraços,
