チャレンジ #57: Coviz-19

[SaoriG]

先週のチャレンジに対する解答は こちらをご覧ください。 

今週は興味深いデータの可視化に挑戦しましょう。SARS-CoV-2 (COVID-19 のウィルス名) の RNA シーケンシング を解析してグリッドとして可視化していきましょう。

RNA はG、T、A、C の塩基対から成り立っているので、可視化には4つの色が必要です。グリッドを作成するときは、順序を左から右に並べてみてください。たとえば、最初の塩基対は A-T-T-A です。A が行 1 列 1、T が行 1 列 2 であることを確認しましょう。

行を構成する列の数、または選択する色は完全に自由であなた次第であることに注意してください（このソリューションには178列あります）。

さらに一歩踏み込みたい場合は、まったく新しいものを作成してみましょう!

データソース: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947.3

インスピレーション:
https://www.reddit.com/r/dataisbeautiful/comments/fkwova/oc_rna_sequence_of_covid19_this_8kb_of_data...

[DaisukeTsuchiya]

グリッド作成で行き詰まり、英語版のスポイラをチラ見してしまいました。

スポイラ

グラフ作成は普段Tableauに持って行ってしまうので、Alteryxの機能は未だに慣れないです。いまいち使いづらい気がしますが。結局ポリゴン作成はあきらめて、ヒートマップを使いました。

[AkimasaKajitani]

答え合わせしにくい問題ですね・・・。

スポイラ

先週の英語版の問題でしたね。
英語版見てると、チャートでやる人とSpatialでやる人と2つに別れていましたが、英語版はSpatialの方が人数が多い印象です・・・。
でもなんか個人的にはSpatialでやるのが気持ち悪いので・・・。

 

 

[ykanemoto]

正解しているかどうか答え合わせはできないけれど、なんとか答えを導き出すことができました。

考え方はあっていると思うのですが。

スポイラ

 

[smiyazawa]

チャートの設定方法に苦労しました。答え合わせができないので、合っているかどうか分りません。

スポイラ

[Qiu]

少し難しかったです。

スポイラ

[gawa]

スポイラ

0点の位置が回答と上下逆ですが。

[ntakeda]

ヒートマップをはじめて作成しました。

勉強になりました。

[Yoshiro_Fujimori]

回答します。

スポイラ

個人的には、列数を変更しやすくしたところが気に入ってます。

[Tokimatsu]

パラメーターで列数を変更できるようにして、グラフと空間の二通りも作ってみました。

スポイラ

どちらも点の大きさを決め打ちで設定して、それっぽく見えるようにしてます。
それっぽく見えるようにするところで手間がかかってます。